本科門診將陸續添購聽性腦幹檢查儀、前庭平衡功能檢查儀、鼻通氣檢查儀、喉閃頻錄影及數位式音聲分析儀、硬式軟式內視鏡及纖維喉、氣管、食道內視鏡,以供教學、治療及研究用。
本科手術室將陸續添購中耳手術顯微器械, 鼻竇內視鏡手術器械以及聲帶顯微手術器械, 以提供台南市民最完善的手術設備.