業務範圍包括門診、病房及各項檢查工作，如：上消化道內視鏡（胃鏡）、下消化道內視鏡（大腸鏡）、乙狀結腸鏡、膠囊內視鏡、經內視鏡逆行性膽胰管造影術、腹部超音波、內視鏡超音波檢查、胃食道酸鹼值監測檢查等。
除提供門診服務、住院醫療照顧及常規性檢查治療外，積極從事研究與教學工作，定期舉辦民眾醫療衛教、學術研討會，更深入社區參與衛教、行動醫院全民健檢活動，以嘉惠台南地區病患。
肝膽胰胃腸疾病與惡性腫瘤診斷及治療、急慢性腹痛、急慢性腹瀉、消化道出血、治療性大腸鏡胃鏡、腹部超音波、消化不良、胃食道逆流、消化性潰瘍、幽門桿菌治療、發炎性腸炎症候群、B型及C型肝炎治療、脂肪肝、肝炎、肝硬化、肝癌、大腸癌、胃癌、消化腫瘤免疫與細胞治療、肝癌射頻燒灼術、縮胃減重與抗酸逆流術
