本科業務涵蓋兩大部分，包含「新陳代謝」與「內分泌」疾病。
新陳代謝疾病 -- 糖尿病、高膽固醇、肥胖症、代謝症候群、骨質疏鬆症
「新陳代謝」疾病泛指和體內能量代謝有關的疾病，最常被提到的就是血糖以及血脂(膽固醇)。代謝性的疾病若長期未加以控制，則會造成全身性的併發症、譬如心血管疾病、腦中風、腎功能惡化等。這些都會造成生活品質的下降、龐大的醫療費用、甚至影響生命。
代謝症候群已經成為全球性的問題，核心問題是腹部肥胖，台灣成年人代謝症候群的盛行率約為每六人就有一人，其成因和不健康的生活作息和飲食息息相關。但是民眾對其認知仍相當有限，這要透過衛教宣導和加強篩檢來達到目的。
在台灣，每十人就約有一名糖尿病患者，而且許多病人罹病多年仍不自知，一旦確診糖尿病，是要透過醫療團隊的合作才能良好控制。 本院糖尿病照護團隊由新陳代謝科醫師、糖尿病衛教師與營養師所組成，配合國健署「糖尿病共同照護網」。目前全院共有10位糖尿病照護網醫師、2名衛教師、5名營養師，能給予相當完善的糖尿病治療與追蹤。
內分泌疾病 -- 甲狀腺、副甲狀腺、腦下垂體、腎上腺、續發性高血壓
內分泌疾病最常見的則為甲狀腺，又分成甲狀腺功能異常和甲狀腺腫大。甲狀腺亢進可能因為心悸，手抖，體重下降而被發現，可以選擇使用藥物、放射碘、手術的方式治療。而甲狀腺腫通常是脖子腫大或摸到一顆腫塊而發現，可由超音波及甲狀腺穿刺來診斷。其他包含各類型內分泌異常問題，都可至本科門診諮詢。
1. 各種糖尿病及其急性、慢性併發症的診療 2. 低血糖、胰臟內分泌腫瘤的診療 3. 代謝症候群的診療、肥胖症及體重控制 4. 腦垂體疾病或腦垂腺瘤 〈功能不足、巨人症或肢端肥大症、庫欣氏症等〉 5. 甲狀腺機能亢進、機能低下症、甲狀腺結節、甲狀腺炎、甲狀腺癌 6. 副甲狀腺高能、低能症及腺瘤或增生 7. 腎上腺 〈皮質、髓質〉 功能異常及腫瘤 8. 性腺等功能異常及腫瘤 9. 骨質疏鬆症
