胸腔外科治療涵蓋之範圍頗廣,包括肺臟、食道、氣管、縱膈、橫膈、胸壁及胃賁門等器官,常見包括肺癌、食道癌、肺結節、自發性氣血胸、膿胸、胸部外傷、多汗症、或縱膈腔腫瘤等疾病,而胸廓畸形之矯正手術,亦屬本科治療範圍。